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使用入门

HPC-1提交作业

命令行方式提交作业过程
1、在根目录编辑脚本 vim submit.pbs    (i进入编辑状态;esc退出编辑状态;“:wq”保存退出)

#PBS -N myjob                                      //作业名称
#PBS -q CPUDefq                                    //队列名称
#PBS -o my.out                                     //输出文件
#PBS -e my.err                                     //错误文件
#PBS -l nodes=1:ppn=36                             //申请资源:1个节点,36核心
cd $PBS_O_WORKDIR

export g09root=/data/apps                               
export LD_LIBRARY_PATH=$g09root/g09/linda8.2:$g09root/g09/linda8.2/common/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export GAUSS_SCRDIR=/home/tmp
export PATH=$g09root/g09:/data/apps/g09/linda-exe/:$PATH
source $g09root/g09/bsd/g09.profile
g09 p.gjf

  

2、上传输入文件,一个作业一个文件夹。
3、拷贝脚本    cp submit.pbs  文件夹名
4、修改文件夹中的脚本
     根据pestat查看机器空闲情况,修改队列名、核心数和输入文件名

5、提交作业    qsub   submit.pbs
6、查看作业    qstat
7、删除不需要的作业  qdel <jobid>