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使用入门

HPC-2提交作业

命令行方式提交作业过程
1、在根目录编辑脚本 vim submit.sh    (i进入编辑状态;esc退出编辑状态;“:wq”保存退出)
#BSUB -q qhpc2          (队列名:qhpc2、qhpc3-8、qhpc3-12 )
#BSUB -app ms80         (应用名:bapp命令可以查看应用名称)
#BSUB -o %J.out         (输出文件)
#BSUB -e %J.err         (错误文件)
#BSUB -n 20             (申请核心数)
#BSUB -R "span[hosts=1]"                 (限制核心都在一个机器里,可省)
RunMatServer.sh -np 12  inputfile        (执行命令)

2、上传输入文件,一个作业一个文件夹。
3、拷贝脚本    cp submit.sh  文件夹名
4、修改文件夹中的脚本
     根据bhosts查看机器空闲情况,修改队列名、核心数和输入文件名

5、提交作业    bsub   <  submit.sh
6、查看作业    bjobs
7、bhist 显示最近完成作业或正在运行作业的历史情况  bhist <jobid>
8、删除不需要的作业  bkill <jobid>
9、监视作业运行  bpeek <jobid>
10、显示队列信息 bqueues
11、显示可用的应用 bapp
12、显示各节点作业情况
bhosts hpc2
bhosts hpc3-8
bhosts hpc3-12